Rao, P., Shukla, A., Parmar, P., Rawal, R. M., Patel, B., Saraf, M., & Goswami, D. (2020). Reckoning a fungal metabolite, Pyranonigrin A as a potential Main protease (Mpro) inhibitor of novel SARS-CoV-2 virus identified using docking and molecular dynamics simulation. Biophysical Chemistry, 264, 106425.
El nuevo SARS-CoV-2 es el agente etiológico que causa la enfermedad del Coronavirus 2019 (COVID-19), que continúa convirtiéndose en un brote pandémico inevitable. En un corto período de tiempo, se identificaron las estructuras de las proteínas diana terapéuticas para el SARS-CoV-2 basándose en la estructura modelada por homología de una transmisión similar del SARS-CoV de 2003. Desde el inicio de la enfermedad, la comunidad de investigadores ha estado buscando una potencial diana farmacológica.
De todas las estructuras resueltas conocidas relacionadas con el SARS-CoV, la proteasa principal (Mpro) se considera una diana de fármaco antiviral atractiva debido a su papel en la replicación viral y su probable competencia no interactiva para unirse a cualquier proteína huésped viral.
Hasta donde sabemos, hasta la fecha solo se ha identificado y probado un compuesto in vivo como un potente inhibidor de la proteína Mpro, denominado N3 (PubChem Compound CID: 6323191) y se sabe que se une de manera irreversible a Mpro suprimiendo su actividad. Utilizando un enfoque computacional, tenemos la intención de identificar un metabolito fúngico natural probable para interactuar e inhibir Mpro.
Después de seleccionar varias moléculas pequeñas para el acoplamiento molecular y la simulación de la dinámica, proponemos Pyranonigrin A, un metabolito fúngico secundario que posee un potente potencial inhibitorio contra la proteasa principal (Mpro) expresada en el virus SARS-CoV-2.